Tras la hibridación, los EUROArray se leen en el EUROArrayScanner. El software EUROArrayScan reconoce automáticamente las posiciones de los arrays y cuantifica las señales de los puntos correspondientes a cada sonda de ADN. En tan solo unos segundos, el software calcula los resultados de la prueba para todas las muestras a partir de la intensidad de las señales y documenta los resultados. Los amplios controles integrados se tienen en cuenta automáticamente. No es necesaria la evaluación ni la interpretación manual de las señales.
El software EUROArrayScan genera un protocolo de trabajo claro para cada ensayo, lo que facilita y asegura el procesamiento de las muestras.
Al emitir los resultados finales, el usuario puede elegir entre visualizar una visión general de todas las muestras con sus respectivos resultados y/o un informe detallado individual con todos los resultados parciales y la imagen correspondiente del array para verificar los resultados finales sugeridos. El usuario también puede añadir comentarios individuales.
Los resultados se almacenan automáticamente junto con los datos de imagen, eliminando la necesidad de archivar manualmente los EUROArrays incubados. Además, el software EUROArrayScan puede conectarse a un LIS para un procesamiento de datos continuo y sin interrupciones.